HPC集群中一些系统维护工作不需要立刻执行,而希望在不影响用户正常使用的情况下见缝插针的进行,这个时候可以将这些维护工作做成作业,通过作业调度系统来调度完成。下面以通过LSF作业调度系统升级Infiniband卡固件和驱动为例:
- 允许root用户提交作业
- 修改lsf.conf,添加一行
LSF_ROOT_REX=local
- 重启相关服务让修改生效
$ badmin mbdrestart $ lsadmin resrestart all
- 修改lsf.conf,添加一行
- 编写升级脚本
cd /root/mellanox/ #进入目录 unzip fw-ConnectX3Pro-rel-2_35_5100.zip mstflint -d 08:00.0 -i ./fw-ConnectX3Pro-rel-2_35_5100-FlexBoot-3.4.648-CLP-8025-UEFI-14.8.43.bin b #升级固件 tar xf MLNX_OFED_LINUX-3.1-1.0.3-rhel6.7-x86_64.tgz cd MLNX_OFED_LINUX-3.1-1.0.3-rhel6.7-x86_64 yum install perl pciutils python gcc-gfortran libxml2-python tcsh libnl.i686 libnl expat glib2 tcl libstdc++ bc tk gtk2 atk cairo numactl pkgconfig -y ./mlnxofedinstall --all --enable-affinity --enable-mlnx_tune <<< "y\n" #安装新版驱动 sed -i s/HWADDR=/#HWADDR=/ /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-ib0 cd rm -rf /root/mellanox #删除升级目录 reboot #重启
- 将升级所需文件复制到所有节点
pscp -r mellanox node:/root/
- 编写作业提交脚本
如果队列之间有抢占,系统维护作业需要提交到低优先级队列,提交到高优先级队列会造成重启时还有被抢占挂起的作业
首先关闭节点,再进行维护作业,完成后再打开节点#!/bin/bash for i in `cat nodelist` #nodelist文件中是所有需要升级节点的主机名列表 do bsub -q e52680v3ib -n 24 -m $i -o $i "badmin hclose $i;/root/mellanox/up.sh;badmin hopen $i" done
非常有意思的思路!你在管理一个LSF的集群?
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